最近，来自中国科学院遗传学与发育生物学研究所的院士Cao Xiaofeng团队，天津师范大学生命科学学院的Ma Xuan博士和中国科学生命科学团队的Luan Weijiang博士发表了一份具有Trnna和Trnna-trnna的表达式的研究论文（植物中的TRF种群。这项研究使用tRNA-seq和yamat-seq技术系统来识别植物tRNA和tRNA衍生片段（TRF）的表达谱，并定量分析植物tRNA和TRFS种群，揭示了植物tRNA基因表达的不均匀性和组织特异性。此外，研究发现，拟南芥13-和16-核苷酸长度的微小TRF具有极高的丰度，为研究植物中小RNA的新线索提供了新的线索。

这项研究使用了最新的tRNA-seq和yamat-seq技术来系统地识别拟南芥，大米，玉米，大豆，小麦，大麦，高粱和小米中的tRNA和trfs。拟南芥根，茎，叶子，花和角果的测序结果表明，大约一半的tRNA基因是静音的，其表达量仅占总tRNA丰度的1（图1）。 tRNA基因表达的这种不均匀性也存在于大米和其他几种作物中。这项研究对不同植物的tRNA转录组进行了比较分析，发现同一引擎tRNA家族成员的表达谱显示了物种之间的保守特征。

图1拟南芥tRNA基因表达不平衡

该研究还深入分析了植物TRF人群的组成。根据TRF的丰度，将拟南芥TRF分为五个主要类别，其中5'tRNA半分子占最大比例，其次是TRF-5，而其他三种类型的TRF（TRF-3，5'TRNA Semimimolimolecules and Central TRF）具有相当的丰度。对拟南芥和水稻不同组织的分析表明，根中TRF的丰度明显低于叶片中的TRF，因此TRF的表达是高度组织特异性的。此外，研究人员发现，不同植物中广泛存在着一类18个核苷酸长的小trf。拟南芥中的微小TRF主要是13个核苷酸和16个核苷酸，均为TRF-5类型。对DICER样1突变体的进一步分析发现，突变体中的MicroTRF的丰度减少，表明它们的产生可能与迪切尔核酸酶有关（图2）。

图2 Micro TRF广泛存在于各种植物中

Finally, the researchers developed a bioinformatics tool tRFanalyzer, which analyzes plant tRNA and tRFs, and created a tRFs database for model plant Arabidopsis and rice (http://www.biosequencing.cn/tRFanalyzer/), so that researchers in the plant field can query and analyze the spatiotemporal expression of plant tRNA and tRFs.

总而言之，这项研究使用了高通量测序技术来揭示植物tRNA和TRFS种群的组成和表达特征，并发现很小的TRF占很高比例的，为植物TRF的研究提供了新的线索。